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面向儿童脑肿瘤分割的无监督域迁移

图像与视频处理 2024-06-25 v1 计算机视觉与模式识别

摘要

针对成人低骨髓瘤已取得显著进展,构建精确自动分割模型。然而,这些模型常常在应用于儿童低骨髓瘤时性能下降,由于其影像和临床差异(域迁移)。获取足够的儿童低骨髓瘤标注数据通常困难,因为该疾病罕见。此外,手动标注也有限且昂贵。本文提出Domain-Adapted nnU-Net (DA-nnUNet) 用于从成人低骨髓瘤(源域)进行无监督域适应到儿童低骨髓瘤(目标域)。具体而言,我们在主干 nnU-Net 上添加一个与梯度反转层(GRL)相连的域分类器。一旦分类器达到非常高的准确率,GRL 就被激活,其目标是将来自分类器的域不变特征迁移到分割模型中,同时保持对源域的分割准确性。分类器的准确率会逐渐下降到随机水平。目标域不使用任何标注。该方法使用BraTS-成人低骨髓瘤数据(N=1251)和BraTS-儿童低骨髓瘤数据(N=99)进行与8种不同监督模型的比较。该方法在肿瘤核心(TC)区域显示出显著的性能提升:Dice 评分提高约32%,95百分位 Hausdorff 距离提高约20。此外,我们的无监督方法在TC区域与仅使用两个数据集手动标注的实用上限模型相比,没有统计学显著差异。代码已共享于https://github.com/Fjr9516/DA_nnUNet。

关键词

引用

@article{arxiv.2406.16848,
  title  = {Unsupervised Domain Adaptation for Pediatric Brain Tumor Segmentation},
  author = {Jingru Fu and Simone Bendazzoli and Örjan Smedby and Rodrigo Moreno},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2406.16848},
  year   = {2024}
}

备注

10 pages, 4 figures, conference