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MRI分割中域偏移对U-Net各层影响的剖析

计算机视觉与模式识别 2021-07-13 v1 机器学习 图像与视频处理

摘要

域适应(Domain Adaptation, DA)方法被广泛用于医学图像分割任务,以解决训练(源)数据与测试(目标)数据分布不同的问题。我们考虑具有少量目标域标注样本的监督域适应任务,这对应于最相关的临床场景之一:在尽可能少的标注数据上构建足够准确的模型。现有方法大多对预训练卷积神经网络(Convolutional Neural Network, CNN)的特定层进行微调。然而,对于哪些层更适合微调尚无共识,例如对于具有低级域偏移的图像微调前几层,或对于具有高级域偏移的图像微调更深层。为此,我们提出SpotTUnet——一种自动选择应最优微调层的CNN架构。更具体地说,在目标域上,我们的方法额外学习一个策略,指示特定层应当被微调还是从预训练网络中复用。我们表明,即使在标注数据极度匮乏的情况下,我们的方法也能达到非灵活微调方法中最佳方法的同等水平。其次,我们表明SpotTUnet策略提供了域偏移对网络影响的逐层可视化,可进一步用于开发鲁棒的域泛化方法。为了广泛评估SpotTUnet性能,我们使用公开可用的脑MR图像数据集(CC359),其具有显式的域偏移。我们发布了可复现的实验流程。

关键词

引用

@article{arxiv.2107.04914,
  title  = {Anatomy of Domain Shift Impact on U-Net Layers in MRI Segmentation},
  author = {Ivan Zakazov and Boris Shirokikh and Alexey Chernyavskiy and Mikhail Belyaev},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2107.04914},
  year   = {2021}
}

备注

Accepted for MICCAI-2021 conference