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UniZyme:基于酶活性位点知识增强的统一蛋白酶切割位点预测器

定量方法 2026-02-03 v3 人工智能 机器学习

摘要

酶催化的蛋白质切割是许多生物学功能的关键步骤。准确预测切割位点可促进药物开发、酶设计以及更深入的生物机制理解。然而,大多数现有模型局限于单个酶,忽略了酶之间的共享知识,无法对新型酶进行泛化。因此,我们引入了一个名为 UniZyme 的统一蛋白酶切割位点预测器,能够跨越多种酶进行泛化。为增强酶的编码以用于蛋白酶切割位点预测,UniZyme 采用了一种新型受生物学启发的模型架构,结合了谷蛋白酶活性位点的知识。广泛的实验表明,UniZyme 在预测多种谷蛋白酶的切割位点方面实现了高准确率,包括未见过的酶。代码已公开于 https://github.com/Ao-LiChen/UniZyme

关键词

引用

@article{arxiv.2502.06914,
  title  = {UniZyme: A Unified Protein Cleavage Site Predictor Enhanced with Enzyme Active-Site Knowledge},
  author = {Chenao Li and Shuo Yan and Enyan Dai},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2502.06914},
  year   = {2026}
}

备注

22 pages,9 figures