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链环穿孔易位:链环复杂度与尺寸的影响

统计力学 2020-06-24 v1 软凝聚态物质 生物物理 计算物理 生物大分子

摘要

我们利用朗之万动力学模拟了连接聚合物环在窄孔中的受迫易位。在固定尺寸(即固定单体数)下,易位时间依赖于链环类型以及环是否打结。对于由两个无结环组成的链环,环间的交叉会减缓易位,并导致交叉穿过孔时产生延迟。结果落在不同链环族的一组相对平滑的曲线上,且在同一族内易位时间并非总是随交叉数增加而增加。当一个环打结时,结果依赖于链环是素链环还是复合链环;在复合情形下,还依赖于打结环或无结环哪个先进入孔中。我们在三组分链环中发现类似情况,其结果依赖于链环是素的还是复合的。这些结果有助于我们理解丝状物间的纠缠复杂度如何影响其易位动力学,并应有助于扩展纳米孔传感技术以探测这些系统的拓扑性质。

关键词

引用

@article{arxiv.2002.04473,
  title  = {Translocation of links through a pore: effects of link complexity and size},
  author = {Michele Caraglio and Enzo Orlandini and Stuart G Whittington},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2002.04473},
  year   = {2020}
}

备注

15 pages, 7 figures