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生化网络中延迟信息传输的权衡

分子网络 2015-09-30 v1

摘要

为了传输生化信号,生物调控系统耗散能量并伴随熵产生。此外,信号传导常在苛刻的环境条件下进行。在一个由输入和延迟输出构成的简单模型调控电路中,我们探究了信息传输与系统能量效率之间的权衡。在给定固定熵产生量和延迟响应的情况下,我们确定了信息量最大的网络,并探讨了含反馈与不含反馈两种情况。我们发现反馈使得该电路能够克服能量约束,即使在无耗散极限下也能传输接近最大可用信息。以休克响应为特征的负反馈环在高耗散下最优。接近平衡时,以其稳定性著称的正反馈环变得信息量更大。探究信号网络应如何构建以在最恶劣可能环境中(而非最优调谐或稳态下)最佳运作,我们发现,在大耗散下,同样的普适模体在所有这些条件下均为最优。

关键词

引用

@article{arxiv.1504.03637,
  title  = {Trade-offs in delayed information transmission in biochemical networks},
  author = {Francesca Mancini and Matteo Marsili and Aleksandra M. Walczak},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1504.03637},
  year   = {2015}
}

备注

25 pages, 15 figures