面向对比度无关脊髓软分割的研究
图像与视频处理
2025-05-05 v2 计算机视觉与模式识别
摘要
脊髓分割具有临床意义,尤其用于计算脊髓横截面积(CSA)以诊断和监测脊髓压迫或多发性硬化等神经退行性疾病。尽管已有若干半自动与自动方法,一个关键局限依然存在:分割依赖于 MRI 对比度,导致不同对比度下 CSA 不同。这部分源于脊髓与脑脊液之间边界外观随序列和采集参数而变化。这种对比度敏感的 CSA 在协议可能不同的多中心研究中增加了变异性,降低了对细微萎缩的检测灵敏度。此外,现有方法通过为每个对比度训练一个模型来增强 CSA 变异性,同时产生未考虑部分容积效应的二值掩码。本工作中,我们提出一种基于深度学习的方法,生成脊髓的软分割。利用健康受试者的 Spine Generic 公共数据库(;),我们首先通过对全部 6 种对比度的二值分割取平均,生成受试者层面的软真值(GT)。这些软 GT 连同激进的数据增强与基于回归的损失函数,被用于训练一个用于脊髓分割的 U-Net 模型。我们将所提模型与最先进方法比较,并开展了涉及不同损失函数与域泛化方法的消融实验。结果表明,使用软分割配合回归损失函数降低了 CSA 变异性(,Wilcoxon 符号秩检验)。所提出的脊髓分割模型在未见的数据集、厂商、对比度及病理(压迫、病灶)间比最先进方法泛化更好,同时考虑了部分容积效应。
引用
@article{arxiv.2310.15402,
title = {Towards contrast-agnostic soft segmentation of the spinal cord},
author = {Sandrine Bédard and Enamundram Naga Karthik and Charidimos Tsagkas and Emanuele Pravatà and Cristina Granziera and Andrew Smith and Kenneth Arnold Weber and Julien Cohen-Adad},
journal= {arXiv preprint arXiv:2310.15402},
year = {2025}
}
备注
Revision Submitted to Medical Image Analysis