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一种对比度无关的 MRI 分割学习策略

图像与视频处理 2021-04-09 v3 计算机视觉与模式识别

摘要

我们提出一种深度学习策略,首次实现了对完全未预处理的脑 MRI 扫描的对比度无关语义分割,且无需针对新模态进行额外训练或微调。经典贝叶斯方法以无监督强度模型解决该分割问题,但需大量计算资源。相比之下,基于学习的方法在测试时可能很快,但对训练可用数据敏感。我们提出的学习方法 SynthSeg 利用一组训练分割(无需强度图像)在训练过程中动态生成对比度差异广泛的合成样本图像。这些样本使用经典贝叶斯分割框架的生成模型产生,其外观、形变、噪声与偏置场的参数随机采样。由于每个 mini-batch 具有不同的合成对比度,最终网络不会偏向任何 MRI 对比度。我们在包含超过 1,000 名受试者与四类 MR 对比度的四个数据集上全面评估了我们的方法。结果表明,我们的方法成功分割数据中的每一种对比度,性能略优于经典贝叶斯分割,且速度快三个数量级。此外,即使在同类 MRI 对比度内,与采用真实图像训练相比,我们的策略跨数据集泛化能力显著更强。最后,我们发现合成广泛范围(即便不真实)的对比度可提升神经网络的泛化能力。我们的代码与模型开源于 https://github.com/BBillot/SynthSeg。

关键词

引用

@article{arxiv.2003.01995,
  title  = {A Learning Strategy for Contrast-agnostic MRI Segmentation},
  author = {Benjamin Billot and Douglas Greve and Koen Van Leemput and Bruce Fischl and Juan Eugenio Iglesias and Adrian V. Dalca},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2003.01995},
  year   = {2021}
}

备注

19 pages, 5 figures