TigerLily：利用图在硅基计算中寻找药物相互作用
机器学习
2022-04-19 v1 人工智能
社会与信息网络
定量方法
摘要
Tigerlily 是一个基于 TigerGraph 构建的系统，旨在解决药物相互作用预测任务。在这一机器学习任务中，我们希望预测两种药物是否具有不良相互作用。我们的框架使我们能够通过图挖掘技术按以下步骤解决这一高度相关的现实问题：(a) 使用 PyTigergraph 创建药物与蛋白质的异质生物图。(b) 在 TigerGraph Cloud 中计算药物节点的个性化 PageRank 分数。(c) 利用个性化 PageRank 矩阵的稀疏非负矩阵分解对节点进行嵌入。(d) 使用节点嵌入训练基于梯度提升的药物相互作用预测器。
引用
@article{arxiv.2204.08206,
title = {TigerLily: Finding drug interactions in silico with the Graph},
author = {Benedek Rozemberczki},
journal= {arXiv preprint arXiv:2204.08206},
year = {2022}
}