标准遗传密码演化的三个阶段:翻译如何启动
种群与进化
2007-11-06 v1
摘要
我们提出了一种原始遗传密码,仅分配了四个密码子:GGC 代表甘氨酸,GAC 代表天冬氨酸/谷氨酸,GCC 代表类丙氨酸,GUC 代表类缬氨酸。模糊性减少的途径扩大了密码子库,增加了 CUC(代表亮氨酸)、AUC(代表异亮氨酸)、ACC(代表类苏氨酸)和 GAG(代表谷氨酸)。在密码子演化的下一个阶段,以消除无义密码子为主题,引入了 UNN 反密码子,从而在原始的镜像结构之上叠加了一个家族盒结构。最后,在剩余的密码子库扩展过程中,生长速率成为主导主题,解释了氨酰-tRNA 合成酶的有序系统发育模式。本文强调了天然适配体在该过程中的特殊作用,并表明密码子的误差鲁棒性特征是通过逐步、受限地扩大 tRNA 库演化而来的,而非通过测试无数种密码子的 exhaustive 选择过程。
引用
@article{arxiv.0711.0700,
title = {Three phases in the evolution of the standard genetic code: how translation could get started},
author = {Peter van der Gulik},
journal= {arXiv preprint arXiv:0711.0700},
year = {2007}
}