去而复返：桥接介观与纳米尺度以理解脂质囊泡图案化
软凝聚态物质
2024-01-12 v1
摘要
我们描述了一套完整的方法论，用以桥接经历相分离的脂质膜和囊泡中纳米尺度分子动力学与（微米级）介观尺度蒙特卡罗模拟之间的尺度，其中还嵌入了弯曲分子物种。为了从分子尺度过渡到介观尺度，我们特别诉诸物理重整化论证，使我们能够严格地从其分子对应物推断介观相互作用参数。我们还解释了如何处理介观尺度上涉及的物理时间尺度。模拟如此获得的介观系统使我们能够平衡所关注囊泡的长波波长，直至囊泡尺寸。反过来，我们随后从介观尺度反向映射到纳米尺度，这使我们能够依次平衡短波波长，直至分子长度尺度。通过将我们的方法应用于囊泡膜图案化的特定情形，我们展示了宏观膜因此可以在所有长度尺度上以可实现的计算机时达到平衡，为解决大型生物膜系统模拟中时间尺度的根本挑战提供了一种原创策略。
引用
@article{arxiv.2401.05785,
title = {There and back again: bridging meso- and nanoscales to understand lipid vesicle patterning},
author = {Julie Cornet and Nelly Coulonges and Weria Pezeshkian and Maël Penissat-Mahaut and Siewert-Jan Marrink and Nicolas Destainville and Matthieu Chavent and Manoel Manghi},
journal= {arXiv preprint arXiv:2401.05785},
year = {2024}
}