生物分子混合物中多相共存的理论与模拟
生物物理
2023-07-11 v1 软凝聚态物质
生物大分子
摘要
生物分子凝聚体是构成活细胞中一种新近被认识的空间组织形态。尽管许多凝聚体被认为由相分离形成,但决定异质生物分子混合物相行为的物理化学属性才刚刚开始被探索。理论与模拟为探究分子决定因素(如蛋白质和 RNA 序列)与此类复杂环境中相分离凝聚体涌现之间的关系提供了宝贵工具。本综述涵盖了在预测和计算设计可相分离为众多共存相的生物分子混合物方面的最新进展。首先,我们回顾了利用理论模型和统计方法理解含数百或数千物种混合物的相行为的努力。随后,我们描述了开发解析理论和粗粒化模拟模型以预测具有联系生物物理实验所需分子细节的多相凝聚体的进展。最后,我们总结了在活细胞内对生物分子混合物非均匀空间组织建模方面面临的挑战。
引用
@article{arxiv.2305.03150,
title = {Theory and simulation of multiphase coexistence in biomolecular mixtures},
author = {William M. Jacobs},
journal= {arXiv preprint arXiv:2305.03150},
year = {2023}
}