纳米物体自组装代码：应用于吸附在金属表面的超分子有机单层
计算物理
2012-11-26 v1 材料科学
摘要
我们实现的纳米物体自组装 (SANO) 代码展示了通过调节分子构建单元及金属基底来预测不同结构基序分子自组装的能力。该代码包含一种二维巨正则蒙特卡洛 (GCMC) 方法，旨在对数千个在金属表面自组装的大有机分子进行原子尺度模拟。通过计算室温下的吸附等温线并覆盖特征亚微米尺度，我们将该方法的鲁棒性与三个不同的已知系统进行了对比：Ag(111) 上的 ZnPcCl8、Au(111) 上的 CuPcF16 以及 Ag(111) 上的 PTBC。我们分别重现了它们的正方形、斜方和六边形超分子铺砌。该代码结合了广义力场以描述分子相互作用，从而为多种有机构建单元和金属表面提供了可迁移性和通用性。
引用
@article{arxiv.1211.5434,
title = {The Self-Assembly of Nano-Objects Code: Applications to supramolecular organic monolayers adsorbed on metal surfaces},
author = {Thomas Roussel and Lourdes F. Vega},
journal= {arXiv preprint arXiv:1211.5434},
year = {2012}
}