细胞核内靶点的搜索动力学
生物大分子
2007-12-21 v1
摘要
转录因子 (TF) 或酶在细胞核内找到靶点所需的平均时间对于转录起始、基因激活或 DNA 修复的启动至关重要。我们获得了当限制在细胞核内的 TF 或酶可以在沿 DNA 的一维运动和拥挤细胞核内的自由 Brown 运动之间切换时，平均搜索时间的新估计值。我们给出了粒子结合在 DNA 上的平均时间 和自由扩散的平均时间 的解析表达式。与先前的结果相反但与实验数据一致，我们发现对于 Lac-I TF 存在因子 。所得出的结合到靶位点所需时间的公式与观测数据一致。我们还得出结论，较高的 DNA 密度会导致更高效的搜索过程。
引用
@article{arxiv.0712.3467,
title = {The search kinetics of a target inside the cell nucleus},
author = {G. Malherbe and D. Holcman},
journal= {arXiv preprint arXiv:0712.3467},
year = {2007}
}