中世纪黑死病病原体的基因组（扩展摘要）

一种距今 650 年、引发中世纪黑死病的鼠疫耶尔森菌（Yersinia pestis）的基因组最近已被测序，并从主染色体组装成 2,105 个重叠群（contigs）。根据点突变记录，该中世纪细菌可能是大多数现存鼠疫耶尔森菌物种的祖先，这为利用比较方法重建这些重叠群的排列顺序开辟了途径。我们表明，旨在通过比较现存基因组来重建祖先基因组组织的最新计算古基因组学方法，可用于校正、排序并补全黑死病病原体基因组的重叠群集合，从而在核苷酸尺度上提供这种古老细菌的完整染色体序列。该序列表明，在黑死病爆发之前曾发生过一次移动元件插入的爆发，导致了异常的基因组可塑性和重排率的增加。