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无标度代谢的免费午餐

分子网络 2017-07-05 v1 统计力学 生物物理

摘要

本文表明,从现实的大规模模型推断出的代谢通量分布中的无标度尾部,可能仅仅是涉及热力学不可行循环的反应所导致的人为假象,这些循环不受物理约束限制,且能够在不消耗自由能的情况下做功。在进行热力学修正后,代谢空间随物理限制因子发生有意义的缩放,进而获得更丰富的多峰结构,这可能在优化目标函数时导致对称性破缺。

关键词

引用

@article{arxiv.1703.00853,
  title  = {The free lunch of a scale-free metabolism},
  author = {Daniele De Martino},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1703.00853},
  year   = {2017}
}

备注

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