稀释系列微生物数据的系统性统计分析
应用统计
2020-03-23 v1
摘要
在微生物研究中，样本常在不同实验条件下处理，然后检测微生物存活情况。一种可追溯至19世纪80年代的技术包括将样本多次稀释并培养各稀释度以肉眼观察微生物菌落形成单位（CFU）的存在。稀释系列数据分析的主要问题在于对样本中原始CFU数量（即零稀释度时）的简单点估计的不确定性量化。对数正态或泊松模型等常用方法似乎不能很好地处理低计数或高计数等极端情况，且存在其他问题。我们基于包含稀释系列的实验流程实际设计，构建了一种新颖的二项模型。对于重复实验，我们为单一实验室的实验结果构建了层次模型，并进而为实验室间分析构建了更高层次的层次结构。结果看似前景良好，可系统处理所有数据情形，包括零值、删失数据、重复、实验室内与实验室间研究。采用贝叶斯方法，使用稳健高效的MCMC方法分析若干真实数据集。
引用
@article{arxiv.2003.09039,
title = {Systematic statistical analysis of microbial data from dilution series},
author = {J Andrés Christen and Al Parker},
journal= {arXiv preprint arXiv:2003.09039},
year = {2020}
}
备注
31 pages, 10 figures