球形病毒衣壳结构作为准晶拼砌
软凝聚态物质
2015-08-04 v2 生物大分子
摘要
具有二十面体对称的球形病毒壳被视为准晶拼砌。与已知的Caspar-Klug准等价理论类似,本方法同样最小化了壳中蛋白质分子与邻近分子结合所需的构象数目,但基于不同的几何原理。假设蛋白质分子中心位于具有等长边的拼砌顶点,且不同拼砌类型的数量最小。获得了六类不同衣壳中按对称性不等价的蛋白质位置的理想化坐标。该方法以统一方式描述了既满足著名Caspar-Klug几何模型又违背该模型的结构。
引用
@article{arxiv.1501.04071,
title = {Structures of Spherical Viral Capsids as Quasicrystalline Tilings},
author = {O. V. Konevtsova and V. L. Lorman and S. B. Rochal},
journal= {arXiv preprint arXiv:1501.04071},
year = {2015}
}
备注
8 pages, 2 figures; This version was published in Physics of the Solid State, 2015, Vol. 57, No.4, pp. 810-814