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随机稀疏抽样:用于可变长度医学时间序列分类的框架

机器学习 2024-10-23 v2

摘要

虽然大多数时间序列分类研究都聚焦于建模固定长度序列,但变量长度时间序列分类(VTSC)在医疗保健领域仍至关重要,此时序列长度可能因患者和事件而异。为解决这一挑战,我们提出一种新颖的VTSC框架,即 Stochastic Sparse Sampling(SSS),专为医学时间序列设计。SSS通过稀疏抽样固定窗口来计算局部预测,然后聚合校准以形成全局预测。我们将SSS应用于癫痫发作区(SOZ)定位,这是一个关键VTSC问题,需要从变长电生理时间序列中识别癫痫诱发脑区。我们在Epilepsy iEEG Multicenter Dataset上对方法进行评估,该数据集来自四个独立医疗中心的异构脑内电生理(EEG)记录。SSS在大多数医疗中心与SOTA基线相比表现出优异性能,在所有离分布(OOD)未见医疗中心也表现出色。此外,SSS天然提供了关于局部信号特征与SOZ相关的后验见解,通过可视化整个信号中各时间点局部预测的平均值来实现。

关键词

引用

@article{arxiv.2410.06412,
  title  = {Stochastic Sparse Sampling: A Framework for Variable-Length Medical Time Series Classification},
  author = {Xavier Mootoo and Alan A. Díaz-Montiel and Milad Lankarany and Hina Tabassum},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2410.06412},
  year   = {2024}
}

备注

20 pages, 8 figures, 2 tables