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利用电子病历中的临床结构稳定稀疏 Cox 模型

机器学习 2014-07-24 v1 机器学习

摘要

临床预测模型的稳定性对于研究间的可迁移性至关重要,但尚未得到充分重视。这一问题在高维数据中尤为突出,而高维数据往往需要具有特征选择能力的稀疏模型。我们引入了一种有效的方法,利用电子病历 (Electronic Medical Records, EMR) 中固有的临床结构来稳定事件发生时间的稀疏 Cox 模型。模型估计通过源自两类 EMR 结构的特征图进行稳定:疾病与干预复发的时间结构,以及医学知识与实践的层级结构。我们在预测心力衰竭患者再入院时间方面证明了该方法的有效性。在两个稳定性指标——Jaccard 指数和一致性指数上,使用临床结构显著提高了特征稳定性,同时未损害判别能力。我们的模型在 6 个月预测中报告了具有竞争力的 AUC 值 0.64(95% 置信区间:[0.58,0.69])。

关键词

引用

@article{arxiv.1407.6094,
  title  = {Stabilizing Sparse Cox Model using Clinical Structures in Electronic Medical Records},
  author = {Shivapratap Gopakumar and Truyen Tran and Dinh Phung and Svetha Venkatesh},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1407.6094},
  year   = {2014}
}

备注

Submitted to International Workshop on Pattern Recognition for Healthcare Analytics 2014, Sweden. Contains 4 pages, 5 figures