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用于电子健康记录死亡率预测的 Uncertainty-Gated 随机序列模型

机器学习 2020-03-03 v1 机器学习

摘要

电子健康记录(EHR)具有非平稳、异构、噪声大和稀疏的特点;因此,学习其中固有的规律或模式具有挑战性。特别是,主要由大量缺失值引起的稀疏性引起了研究人员的关注,他们试图通过定义一个次要插补问题,更好地利用所有可用样本来确定主要目标任务的解决方案。在方法上,现有方法无论是确定性的还是随机性的,都应用了不同的假设来插补缺失值。然而,一旦缺失值被插补,大多数现有方法在下游任务建模中不考虑插补值的保真度或置信度。无疑,缺失变量的错误或不当插补会导致建模困难以及性能下降。在本研究中,我们提出了一种新颖的变分循环网络,其(i)估计缺失变量的分布以表示插补值中的不确定性,(ii)在循环过程中基于插补值的方差显式应用保真度来更新隐藏状态(即不确定性随时间传播),以及(iii)预测院内死亡的可能性。值得注意的是,我们的模型可以在单一流中执行这些过程,并以端到端方式联合学习所有网络参数。我们使用 MIMIC-III 和 PhysioNet challenge 2012 的公开数据集验证了方法的有效性,与实验中考虑的其他用于死亡率预测的 SOTA 方法相比表现更优。此外,我们识别了模型的行为,其很好地表示了插补估计的不确定性,表明计算出的 MAE 与不确定性之间存在高相关性。

关键词

引用

@article{arxiv.2003.00655,
  title  = {Uncertainty-Gated Stochastic Sequential Model for EHR Mortality Prediction},
  author = {Eunji Jun and Ahmad Wisnu Mulyadi and Jaehun Choi and Heung-Il Suk},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2003.00655},
  year   = {2020}
}

备注

11 pages, 4 figures