空间癌症系统生物学解析异型相互作用并识别空间层级破坏作为病理性驱动事件

空间注释的单细胞数据集为剖析发育与疾病中的细胞间通讯提供了前所未有的机遇。异型信号包括不同细胞类型间的相互作用，在组织发育与空间组织中已得到充分确立。上皮组织需要若干紧密调控的不同程序。平面细胞极性（planar cell polarity）是上皮细胞沿垂直于顶-底轴的平面轴的组织方式。在本研究中，我们调查平面细胞极性因子并探索发育调控因子作为恶性驱动因子的意义。利用癌症系统生物学分析，我们推导了皮肤皮肤黑色素瘤中 WNT 配体（WNT）及其同源 frizzled（FZD）受体的基因表达网络。由多序列比对的无监督聚类所支持的表达谱，基于潜在的发育空间程序识别了配体非依赖信号及其对转移进展的意义。组学研究与空间生物学将发育程序与肿瘤事件相联系，并解释了转移侵袭性的关键空间特征。恶性黑色素瘤中显著的平面细胞极性因子（如 WNT 和 FZD 家族的特定代表）的失调，以不受控制且无组织的方式重现了正常黑素细胞的发育程序。