高斯分子表面的稀疏表示
数值分析
2019-09-20 v1 数值分析
摘要
本文提出了一种用于稀疏表示高斯分子表面的模型与算法。原始的高斯分子表面由相对少量的具有旋转椭球特征的径向基函数(RBF)进行逼近。RBF 表示的稀疏性通过求解一个非线性 优化问题来实现。实验结果表明,使用我们的 模型和算法,能够以少得多的 RBF 高精度地表示原始高斯分子表面。高斯分子表面的稀疏表示在多种应用中非常有用,例如分子结构比对、分子面积与体积计算,且该方法原则上可应用于一般形状的稀疏表示和粗粒化分子建模。
引用
@article{arxiv.1909.09095,
title = {Sparse Representation of Gaussian Molecular Surface},
author = {Sheng Gui and Minxin Chen and Benzhuo Lu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1909.09095},
year = {2019}
}