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动态时空阵列模型的稀疏网络估计

统计方法学 2020-07-29 v3

摘要

神经场模型通过突触权重函数描述群体水平的神经元通信。利用电压敏感染料(VSD)成像,可以以较高的空间和时间分辨率获取神经场的测量值。突触权重函数代表了大脑中的功能连接,并产生了一种时空依赖结构。我们提出一种用于神经场建模的随机泛函微分方程,通过对突触权重函数以及时间和空间离散化进行基展开,可导出数据的向量自回归模型。将模型拟合到数据是一个实际挑战,因为这代表一个大规模回归问题。通过使用1-范数惩罚与局部化基函数相结合,可以学习大脑功能连接的稀疏网络表示,但显式构建设计矩阵在计算上仍可能难以承受。我们证明,通过使用张量积基展开,经由近端梯度算法计算惩罚估计量变得可行。计算的关键在于数据以阵列形式组织,正如三维VSD成像数据那样。这允许使用在空间和时间上均高效的阵列算术。所提方法已在CRAN上可用的R包dynamo中实现并展示。

关键词

引用

@article{arxiv.1802.08982,
  title  = {Sparse Network Estimation for Dynamical Spatio-temporal Array Models},
  author = {Adam Lund and Niels Richard Hansen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1802.08982},
  year   = {2020}
}