SOS：用于快速免疫荧光全切片图像分类的选择性物镜切换
计算机视觉与模式识别
2020-08-13 v1
摘要
临床显微镜中处理十亿像素全切片图像（WSIs）的困难长期阻碍计算机辅助诊断系统的实施。由于现代计算资源无法在此极大尺度上执行计算，当前最先进的方法采用基于图块的处理以保留 WSI 分辨率。然而，这些方法通常资源密集，并在处理时间上做出显著妥协。本文中，我们证明对于某些仅需少数情况高分辨率的 WSI 分类任务，常规基于图块的处理是冗余的。这反映了临床实践中的观察：病理学家可能以低倍物镜筛查切片，仅在对发现不确定时切换到高倍。为消除这些冗余，我们提出一种基于降采样 WSI 预测置信度选择性使用高分辨率处理的方法——称之为选择性物镜切换（SOS）。我们的方法在一个由 684 张肝-肾-胃免疫荧光 WSI 组成的新数据集上得到验证，该数据集常规用于自身免疫性肝病的检查。通过将高分辨率处理限制于低分辨率无法自信分类的病例，我们保持了图块级分析的准确率，同时将推理时间降低了 7.74 倍。
引用
@article{arxiv.2003.05080,
title = {SOS: Selective Objective Switch for Rapid Immunofluorescence Whole Slide Image Classification},
author = {Sam Maksoud and Kun Zhao and Peter Hobson and Anthony Jennings and Brian Lovell},
journal= {arXiv preprint arXiv:2003.05080},
year = {2020}
}
备注
Accepted for publication at CVPR2020