无服务器计算为生物医学研究提供按需高性能计算
定量方法
2018-08-01 v1
摘要
云计算提供按需、可扩展的计算与存储，已成为分析生物医学大数据的重要资源。通常的云计算方法要求用户预留和配置虚拟服务器。一种新兴的替代方案是由提供商动态分配机器资源。这类无服务器计算在易用性、即时可扩展性和成本效益方面对生物医学研究具有巨大潜力。在我们的概念验证示例中，我们展示了无服务器计算如何以低成本按需访问数百个 CPU，且几乎无需或只需极少设置。特别地，我们说明使用 Amazon Web Services Lambda 可在约 2 分钟内、以低于 $1 的成本完成所有唯一人类蛋白质之间的全对全两两比较。与在典型笔记本电脑上运行相同任务相比，这实现了 250 倍的加速。
引用
@article{arxiv.1807.11659,
title = {Serverless computing provides on-demand high performance computing for biomedical research},
author = {Dimitar Kumanov and Ling-Hong Hung and Wes Lloyd and Ka Yee Yeung},
journal= {arXiv preprint arXiv:1807.11659},
year = {2018}
}