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通过响应性水凝胶中 DNA 的机械张力感知病毒

生物大分子 2014-04-09 v1 软凝聚态物质 生物物理

摘要

严重病毒感染的迅速全球传播(通常涉及病毒的新变异)给我们的医疗保健系统带来了重大挑战。这意味着非常需要能够高效且特异性地诊断病毒的工具。为了在地方医疗保健中心广泛应用,此类工具应相对廉价且易于使用。在此,我们讨论了基于病毒结合到 DNA 上时诱导一束预拉伸 DNA 分子产生机械应力,从而实现病毒宏观检测的生物物理潜力。我们表明,DNA 对带电病毒表面的亲和力会诱导双螺旋局部熔解成两条单链 DNA。这一过程沿 DNA 链产生机械应力,导致 DNA 整体收缩。我们的结果表明,当此类 DNA 束被纳入支持基质(如响应性水凝胶)时,病毒的存在确实可能导致基质的显著宏观机械变形。我们讨论了这种效应的生物物理基础,并表征了相关 DNA 熔解转变的物理性质。特别是,我们揭示了系统相关物理参数之间的几个缩放关系。我们推广这种基于 DNA 的检测方法,用于高效和特异性的病毒筛查。

关键词

引用

@article{arxiv.1310.5531,
  title  = {Sensing viruses by mechanical tension of DNA in responsive hydrogels},
  author = {Jaeoh Shin and Andrey G. Cherstvy and Ralf Metzler},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1310.5531},
  year   = {2014}
}

备注

11 pages, 7 figures, supplementary material included in the source files