基于注意力的组织病理图像细胞核自监督分割
图像与视频处理
2020-07-17 v1 计算机视觉与模式识别
摘要
组织病理图像中细胞核的分割与精确定位是一个极具挑战性的问题,现有方法大多采用监督策略。这些方法通常依赖医学专家耗费大量时间与精力进行的手动标注。在本研究中,我们提出了一种用于全切片组织病理图像细胞核分割的自监督方法。我们的方法基于如下假设:细胞核的大小与纹理可决定提取图像块时的放大倍数。我们表明,识别图像块的放大倍数级别可为细胞核定位生成初步的自监督信号。我们进一步表明,通过对模型施加适当约束,可作为主放大倍数识别任务的辅助输出获取有意义的分割图。我们的实验表明,经标准后处理后,我们的方法在公开可用的 MoNuSeg 数据集上优于其他无监督细胞核分割方法,并报告了与监督方法相近的性能。我们的代码与模型已在线提供以促进进一步研究。
引用
@article{arxiv.2007.08373,
title = {Self-Supervised Nuclei Segmentation in Histopathological Images Using Attention},
author = {Mihir Sahasrabudhe and Stergios Christodoulidis and Roberto Salgado and Stefan Michiels and Sherene Loi and Fabrice André and Nikos Paragios and Maria Vakalopoulou},
journal= {arXiv preprint arXiv:2007.08373},
year = {2020}
}
备注
10 pages. Code available online at https://github.com/msahasrabudhe/miccai2020_self_sup_nuclei_seg