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基于自监督学习与协同训练利用病理图像点标注进行细胞核分割

图像与视频处理 2023-08-21 v2 计算机视觉与模式识别 定量方法

摘要

细胞核分割是数字病理中全切片图像分析的关键任务。一般而言,全监督学习的分割性能严重依赖于标注数据的数量与质量。然而,专业病理医生提供准确的像素级真值既耗时又昂贵,而获取如点标注之类的粗标签则容易得多。在本文中,我们提出一种仅需点标注训练的弱监督细胞核分割方法。首先,基于 Voronoi 图和 k-means 聚类方法由点标注导出粗像素级标签以避免过拟合。其次,设计了一种带指数移动平均方法的协同训练策略,以细化粗标签的不完整监督。第三,为病理图像细胞核分割量身定制了一种自监督视觉表示学习方法,将苏木精分量图像转换为 H&E 染色图像,以更好地理解细胞核与细胞质之间的关系。我们使用两个公共数据集对所提方法进行了综合评估。视觉与定量结果均证明了我们的方法优于最先进的方法,并且与全监督方法相比具有竞争力。代码:https://github.com/hust-linyi/SC-Net

关键词

引用

@article{arxiv.2202.08195,
  title  = {Nuclei Segmentation with Point Annotations from Pathology Images via Self-Supervised Learning and Co-Training},
  author = {Yi Lin and Zhiyong Qu and Hao Chen and Zhongke Gao and Yuexiang Li and Lili Xia and Kai Ma and Yefeng Zheng and Kwang-Ting Cheng},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2202.08195},
  year   = {2023}
}

备注

Accepted by MedIA