二维二元准晶的自组装：通往 DNA 准晶的可能途径
软凝聚态物质
2016-11-11 v1 化学物理
摘要
我们使用蒙特卡洛模拟与自由能技术表明，只要以适当方式选择补丁相互作用，五价和六价二维补丁粒子的二元溶液甚至能在极窄补丁宽度下形成热力学稳定的准晶体。此类补丁粒子可被视作 DNA 多臂‘星形’基元的粗粒化表示，通过调节突出臂的 DNA 序列可使其彼此非常特异性地键合。我们探索了几种可能的设计策略，并得出结论：以特定但非过度受限的方式相互作用的 DNA 星形瓦片有可能用于在实验中构造软准晶体。我们利用 oxDNA（一个真实的粗粒化 DNA 模型）验证了此类星形瓦片能形成稳定的十二重对称基元。
引用
@article{arxiv.1607.06626,
title = {Self-assembly of two-dimensional binary quasicrystals: A possible route to a DNA quasicrystal},
author = {Aleks Reinhardt and John S. Schreck and Flavio Romano and Jonathan P. K. Doye},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.06626},
year = {2016}
}