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由基因表达数据构建的反表达基因网络中的标度行为

分子网络 2007-05-23 v1 无序系统与神经网络 统计力学

摘要

我们研究了从多种癌症获得的基因表达数据构建的反表达基因网络。这些网络通过将属于彼此 K-最远邻列表的顶点相连而合成,其中 K 为预先选定的非负整数。在对应最小同质性的 K 范围内,网络的度分布表现出标度行为。这些网络中的聚类系数小于等效随机图中的聚类系数,并且在显著大的 K 之前保持为零。然而,它们的小直径意味着小世界行为,这由其特征谱所证实。我们讨论了这些发现在若干背景下的意义。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0309019,
  title  = {Scaling in Counter Expressed Gene Networks Constructed from Gene Expression Data},
  author = {Himanshu Agrawal},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0309019},
  year   = {2007}
}

备注

4 pages REVTeX