RISMiCal:用于执行快速 RISM/3D-RISM 计算的软件包
化学物理
2024-03-05 v1
摘要
溶剂在溶液相中发生的各种化学、物理和生物过程中起着至关重要的作用。参考相互作用位点模型(RISM)及其三维扩展(3D-RISM)是模拟化学反应、生物功能和结构形成中溶剂化效应的强大计算工具。我们介绍了基于 RISM 和 3D-RISM 理论并带有快速 GPU 代码的 RISM 积分计算器(RISMiCal)程序包。RISMiCal 被开发为一个集成的 RISM/3D-RISM 程序,具有与 Gaussian16、GAMESS 和 Tinker 等外部程序的接口。用 CUDA 编写的用于单 GPU 和多 GPU 代码的快速 3D-RISM 程序将提高这些混合方法的可用性,因为它们需要执行许多计算成本高昂的 3D-RISM 计算。我们期望我们的软件包能够广泛应用于溶剂中的化学和生物过程。RISMiCal 软件包可在 https://rismical-dev.github.io 获取。
引用
@article{arxiv.2403.01039,
title = {RISMiCal: A software package to perform fast RISM/3D-RISM calculations},
author = {Yutaka Maruyama and Nori Yoshida},
journal= {arXiv preprint arXiv:2403.01039},
year = {2024}
}