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RinQ:面向当前量子计算机的蛋白质中心位预测

量子物理 2025-09-12 v2 软凝聚态物质 生物物理 定量方法

摘要

我们提出了 RinQ,一个面向蛋白质功能性关键残基识别的混合量子-经典框架,通过将中心性检测问题形式化为二次无约束二进制优化(QUBO)问题来实现。蛋白质结构被建模为残基相互作用网络(RIN),并使用 D-Wave 的模拟退火算法求解 QUBO 公式。应用于多样化的蛋白质集合时,RinQ 能稳健地识别出与经典基准高度吻合的中心残基,展示了该方法的准确性和鲁棒性。

关键词

引用

@article{arxiv.2508.01501,
  title  = {RinQ: Towards predicting central sites in proteins on current quantum computers},
  author = {Shah Ishmam Mohtashim},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2508.01501},
  year   = {2025}
}