氢键、疏水作用力及坍缩转变的性质
软凝聚态物质
2009-11-07 v1 统计力学
摘要
我们研究了一个包含 54 个氨基酸的模型蛋白的热力学行为，该模型被设计为在其本征态中形成三螺旋簇。模型包含三种类型的氨基酸和每个氨基酸 5-6 个原子，仅使用拉马谢尔扭转角作为其唯一自由度。该力场基于氢键和有效疏水作用力。我们研究了这些力场强度如何影响坍缩转变的性质。对于合适的这两个参数的选择，发现坍缩转变类似于一级转变并与折叠转变重合。还显示，相应的单螺旋和二螺旋片段比三螺旋序列更不稳定地形成次级结构。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0107178,
title = {Ring-Driven Shear Thickening in Wormlike Micelles?},
author = {M. E. Cates and S. J. Candau},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0107178},
year = {2009}
}
备注
To appear in Europhysics Letters