求解蛋白质折叠识别问题的最新进展
定量方法
2007-07-30 v2 分布式、并行与集群计算
摘要
折叠识别方法是通过氨基酸残基序列捕获蛋白质结构的有力工具，但其应用仍受限于对庞大计算资源和合适高效算法的需求。在最新版本的 FROST（折叠识别导向搜索工具）软件包中，由于 IRISA 的 SYMBIOSE 小组与 Jouy-en-Josas 的 MIG 之间的紧密合作，实现了求解蛋白质折叠识别问题（PTP）的最有效算法。在本文中，我们介绍了 FROST 的各个组件，重点介绍了在构建和求解新版本 PTP 方面的最新进展，以及如何在计算机集群上在合理时间内求解上百万个实例。
引用
@article{arxiv.0707.3750,
title = {Recent Advances in Solving the Protein Threading Problem},
author = {Rumen Andonov and Guillaume Collet and Jean-François Gibrat and Antoine Marin and Vincent Poirriez and Nikola Yanev},
journal= {arXiv preprint arXiv:0707.3750},
year = {2007}
}