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拥挤与细胞环境中生物现象建模与模拟的最新进展

生物大分子 2026-05-22 v2

摘要

虽然研究生物现象的实验与计算机模拟通常在稀释的体外条件下进行,但此类现象实际发生在细胞内部——一个充满各类大分子的密集环境中。本文综述了用于研究拥挤与细胞环境的最新计算方法。蛋白质拥挤剂、惰性拥挤剂和小分子被用于模拟拥挤效应。针对细胞质模型进行了模拟。新方法被开发用于模拟拥挤系统,模拟时间可达200微秒。除挑战外,研究细胞内生物现象的建模与模拟是一个快速增长的领域,具有巨大潜力以增进我们对体内此类现象发生机制的理解。

关键词

引用

@article{arxiv.2603.26974,
  title  = {Recent advances in modeling and simulation of biological phenomena in crowded and cellular environments},
  author = {Apoorva Mathur and Vanessa Regina Miranda and Ariane Nunes-Alves},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2603.26974},
  year   = {2026}
}

备注

Updated with comments from reviewers