单蛋白的实时形状近似与五维指纹分析
生物大分子
2017-04-26 v1 软凝聚态物质
生物物理
摘要
本工作利用填充电解质的纳米孔中的 zeptoliter 传感体积，同时实时地确定单个蛋白质的近似形状、体积、电荷、旋转扩散系数和偶极矩。我们已发展出一种理论，用于定量理解并分析由单蛋白在纳米孔内电场中移动时的旋转动力学所引起的离子电流调制。由此产生的多参数信息提出了表征、识别和量化混合物中单个蛋白质及蛋白质复合物的可能性。该方法在溶液中探测单蛋白，并确定诸如近似形状和偶极矩等参数，这些是优异的蛋白质描述符，且无法从溶液中的单蛋白分子以其他方式获得。总之，这种在单粒子层面对生物分子的五维表征具有用于即时蛋白质识别、量化以及可能分选的潜力，对结构生物学、蛋白质组学、生物标志物检测和常规蛋白质分析有意义。
引用
@article{arxiv.1510.01935,
title = {Real-time shape approximation and 5-D fingerprinting of single proteins},
author = {Erik C. Yusko and Brandon R. Bruhn and Olivia Eggenberger and Jared Houghtaling and Ryan C. Rollings and Nathan C. Walsh and Santoshi Nandivada and Mariya Pindrus and Adam R. Hall and David Sept and Jiali Li and Devendra S. Kalonia and Michael Mayer},
journal= {arXiv preprint arXiv:1510.01935},
year = {2017}
}