基于反应分子动力学对自由基致 DNA 损伤初始步骤的研究
生物物理
2016-09-28 v1 化学物理
计算物理
摘要
我们采用基于键级 ReaxFF 的大规模分子模拟来模拟化学反应，并研究溶液中 DNA 大分子片段因电离辐射所受的损伤。我们指出，在含水系统中，作为兆伏级电离辐射主要产物的随机分布的双原子 OH 自由基团簇，是氢抽提以及糖基部分中羰基和羟基形成的主要来源，这些基团在糖环中造成空洞。这些空洞在 DNA 碱基与 DNA 骨架之间缓慢扩大，损伤集体传播至 DNA 单链和双链断裂。
引用
@article{arxiv.1112.2731,
title = {Reactive Molecular Dynamics study on the first steps of DNA-damage by free hydroxyl radicals},
author = {Ramin M. Abolfath and A. C. T. van Duin and Thomas Brabec},
journal= {arXiv preprint arXiv:1112.2731},
year = {2016}
}
备注
6 pages and 8 figures. movies and simulations are available at: http://qmsimulator.wordpress.com/