受基因网络启发的 directed 图的随机化与反馈性质
分子网络
2007-05-23 v1 定量方法
摘要
考虑到基因调控网络的大规模分析，我们回顾了一种称为“去叶”的图删减算法，可用于评估随机图系综中的反馈。在此过程中，我们考虑分析邻接矩阵对角结构化的网络的可能性，即具有固定数量非零对角项。我们在一个固定度的网络模型上用数值和解析计算检验这些想法。我们的结果如下：首先，大系统规模下的去叶行为能够区分反馈的不同 regime。我们展示了它们的关系及其与图中复杂性涌现的联系。其次，对角结构对此行为的影响可能是相关的。
引用
@article{arxiv.q-bio/0606039,
title = {Randomization and Feedback Properties of Directed Graphs Inspired by Gene Networks},
author = {M. Cosentino Lagomarsino and B. Bassetti and P. Jona},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0606039},
year = {2007}
}
备注
To appear in: Proceedings of the CMSB conference, Lecture Notes in Bioinformatics, Springer, 2006