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近似选择性扫荡期间谱系合并的随机划分

概率论 2007-05-23 v2 种群与进化

摘要

当一个有益突变在一个种群中发生时,新的有利等位基因可能扩散至整个种群。这一过程被称为选择性扫荡。假设我们在一次选择性扫荡结束时抽取 nn 个个体。如果我们关注染色体上靠近有益突变位置的一个位点,那么许多谱系很可能 descended 自带有该有益突变的个体,而另一些则因两位点间的重组而 descended 自不同个体。我们引入了对选择性扫荡效应的两种近似。第一种简单但不够精确:抛掷 nn 枚独立硬币,正面概率为 pp,并称硬币正面朝上的那些谱系为 descended 自带有有益突变的个体。第二种近似与 Kingman 的 paintbox 构造相关,它以整值随机变量取代硬币抛掷,并给出非常精确的结果。

关键词

引用

@article{arxiv.math/0411069,
  title  = {Random partitions approximating the coalescence of lineages during a selective sweep},
  author = {Jason Schweinsberg and Rick Durrett},
  journal= {arXiv preprint arXiv:math/0411069},
  year   = {2007}
}