近似选择性扫荡期间谱系合并的随机划分
概率论
2007-05-23 v2 种群与进化
摘要
当一个有益突变在一个种群中发生时,新的有利等位基因可能扩散至整个种群。这一过程被称为选择性扫荡。假设我们在一次选择性扫荡结束时抽取 个个体。如果我们关注染色体上靠近有益突变位置的一个位点,那么许多谱系很可能 descended 自带有该有益突变的个体,而另一些则因两位点间的重组而 descended 自不同个体。我们引入了对选择性扫荡效应的两种近似。第一种简单但不够精确:抛掷 枚独立硬币,正面概率为 ,并称硬币正面朝上的那些谱系为 descended 自带有有益突变的个体。第二种近似与 Kingman 的 paintbox 构造相关,它以整值随机变量取代硬币抛掷,并给出非常精确的结果。
引用
@article{arxiv.math/0411069,
title = {Random partitions approximating the coalescence of lineages during a selective sweep},
author = {Jason Schweinsberg and Rick Durrett},
journal= {arXiv preprint arXiv:math/0411069},
year = {2007}
}