微生物基因组的准复制与普遍长度
生物物理
2007-05-23 v1 基因组学
摘要
对108个微生物完整基因组中短词出现频率分布的统计分析揭示了所有微生物基因组共有的普遍“根序列长度”的存在。这些长度及其普遍性为微生物基因组的生长方式提供了强有力的线索。我们表明，所观察到的基因组特性可以通过一个基因组生长模型来解释，在该模型中，原始基因组主要通过从约200个核苷酸(nt)的初始长度到约一百万个核苷酸(nt)的典型微生物基因组长度的短片段的最大随机重复而生长。本文讨论了这项研究结果与基因组同时随机生长和信息获取的性质、所谓的RNA世界（生命在蛋白质和酶出现之前进化的世界）以及其他几个主题的相关性。
引用
@article{arxiv.physics/0309006,
title = {Quasireplicas and universal lengths of microbial genomes},
author = {Li-Ching Hsieh and Chang-Heng Chang and Liaofu Luo and Fengmin Ji and Hoong-Chien Lee},
journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0309006},
year = {2007}
}
备注
4 pages 3 figures