QuASeR——量子加速的从头 DNA 序列重建
量子物理
2021-06-09 v1 新兴技术
基因组学
摘要
在本文中，我们提出 QuASeR，一种基于门模型与量子退火平台、通过从头组装实现的无参考 DNA 序列重建方案。实现的四个步骤（TSP、QUBO、哈密顿量以及 QAOA）均通过简单概念验证示例加以解释，以自包含的方式面向基因组学研究界与量子应用开发者。我们讨论了量子全栈加速器设计各层的实现细节。我们也强调了当前经典模拟与可用量子硬件系统的局限性。该实现为开源的，可在 https://github.com/prince-ph0en1x/QuASeR 找到。
引用
@article{arxiv.2004.05078,
title = {QuASeR -- Quantum Accelerated De Novo DNA Sequence Reconstruction},
author = {Aritra Sarkar and Zaid Al-Ars and Koen Bertels},
journal= {arXiv preprint arXiv:2004.05078},
year = {2021}
}
备注
24 pages