基于量子网络的癌症驱动基因预测
量子物理
2025-11-05 v2
摘要
癌症驱动基因的识别是开发靶向治疗干预的基本任务。将突变轮廓与蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络整合提供了一种有前景的检测方法[1, 2],但扩展到大型网络数据集在计算上具有挑战性。量子计算提供了紧凑的表示和潜在的复杂度降低。鼓动于 Gumpinger 等人[3]的经典方法,本工作引入一种监督量子框架,将突变得分与网络拓扑结合,通过一种新颖的状态准备方案(Quantum Multi-order Moment Embedding, QMME)实现。QMME 编码了节点直接邻居和二阶邻居突变得分的低阶统计矩,并将此信息编码到量子态中。这些状态用作基于核函数的量子二分类器的输入,用于判别已知驱动基因与其他基因。在经验证的 PPI 网络上的仿真显示,性能与经典基线相当,召回率提升 12.6%。该管道执行显式的量子态准备,不需要经典训练,实现了一种高效、近乎端到端的量子工作流程。简要的复杂度分析表明,该方法可能在网络基础的癌症基因预测中实现量子加速。本工作凸显了监督量子图学习框架在推动生物学发现方面的潜力。
引用
@article{arxiv.2510.12628,
title = {Quantum Network-Based Prediction of Cancer Driver Genes},
author = {Patricia Marques and Andreas Wichert and Duarte Magano and Bruno Coutinho},
journal= {arXiv preprint arXiv:2510.12628},
year = {2025}
}
备注
13 pages, 5 figures