基于从头算势能面的 N-甲基乙酰胺的量子与经典振动弛豫动力学
化学物理
2015-05-13 v1 生物物理
摘要
利用 DFT/B3LYP 和 MP2 水平的广泛量子化学计算，构建了孤立 N-甲基乙酰胺的四次力场。考虑到 24 个振动自由度，该模型被用于对酰胺 I 模的振动能量弛豫进行数值精确的振动组态相互作用计算。研究发现，能量转移路径可能敏感地依赖于理论描述的细节。此外，利用精确的参考计算研究了以下方法的适用性和准确性：(i) 准经典轨迹方法，(ii) 含时二阶微扰理论，以及 (iii) 频率涨落的瞬时简正模描述。基于这些结果，讨论了几种描述生物分子系统中振动能量弛豫的策略。
引用
@article{arxiv.0807.1368,
title = {Quantum and classical vibrational relaxation dynamics of N-methylacetamide on ab initio potential energy surfaces},
author = {Hiroshi Fujisaki and Kiyoshi Yagi and Kimihiko Hirao and John E. Straub and Gerhard Stock},
journal= {arXiv preprint arXiv:0807.1368},
year = {2015}
}
备注
18 pages, 6 figures, submitted to J. Phys. Chem. A