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通过体积时空图像相关光谱学 (vSTICS) 对 Growing cells 中动态 3D 传输进行定量映射

定量方法 2026-03-31 v1 生物物理 亚细胞过程

摘要

对三维 (3D) 流、扩散和颗粒密度进行定量映射在密集的活细胞中仍具有挑战,因为大多数动态光学显微镜测量实际上是平面的,且现有分析方法在处理稠密、嘈杂的体数据方面困难。我们提出体积时空图像相关光谱学 (vSTICS),该框架从 3D 荧光时间序列中恢复体素分辨率的流速、扩散系数和颗粒密度。通过场合成晶体光学片显微镜成像的 Growing Camellia japonica 粉刷管,应用局部 3D 时空相关分析于重叠的体积样本上,生成 velocity、扩散和密度的图。用人工合成的 flow-diffusion 模拟验证表明,该方法能够准确恢复所设定的传输参数,包括接近 33 μ\mum s1^{-1} 的速度和 10310^{-3} μ\mum2^2 s1^{-1} 级别的扩散系数。荧光微珠实验验证了颗粒数和点扩散函数的读出,并测得 gel 中扩散系数为 0.3±0.10.3 \pm 0.1 μ\mum2^2 s1^{-1},与 imaging-FCS 测得的 0.5±0.20.5 \pm 0.2 μ\mum2^2 s1^{-1} 一致。应用于粉刷管中的线粒体,vSTICS 解析出双向反向喷泉模式,呈现慢速正向运输 (0.10.1-11 μ\mum s1^{-1}) 和速度峰值接近 33 μ\mum s1^{-1} 的快速逆向运动,另外约 22 μ\mum 宽的逆向走廊。密度和扩散图显示更稠密、更具迁移性的核心区域,以及更高的周边扩散。高密度亚衍射 vesicle 映射产生类似的速度图谱,粒子密度约高十倍。这些结果表明 vSTICS 是一种实用的 3D 细胞内传输定量映射方法,并通过揭示主要为横向循环的非对称性,细化了反向喷泉模型。

关键词

引用

@article{arxiv.2603.27484,
  title  = {Quantitative mapping of dynamic 3D transport in growing cells via volumetric spatio-temporal image correlation spectroscopy (vSTICS)},
  author = {Ahmad Mahmood and Paul W. Wiseman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2603.27484},
  year   = {2026}
}

备注

23 pages, 7 figures. Submitted to Nature Methods