通过无谐振低频振动的蛋白质-水能量传递
软凝聚态物质
2026-01-07 v1 统计力学
摘要
热量散失是生命系统中普遍现象,系统不断将不同形式的能量相互转换。液体甚至蛋白质内部的热能传输已为人所熟知,但跨异构分子边界的动能传递提供了额外挑战。本研究在稳态条件下使用原子分子动力学模拟,分析蛋白质如何将多余热能传递给周围溶剂。我们特别关注支配系统动力学的集体自由度,从扩散介质到中红外频率范围。通过全无谐振振动分析,我们分析了振动光谱、温度和热传递效率。我们发现,与溶剂介导的摩擦相关的能量传递机制最为高效。然而,这一机制仅适用于蛋白质少数自由度。相反,远红外范围内较不有效的振动能量传递主导整体热传递,因为该频率范围内振动模式数量较大。本工作的一个显著副产品是一种高度敏感的能量等分原偏差测度,可用于分析非ergodic性质。
引用
@article{arxiv.2601.02699,
title = {Protein-Water Energy Transfer via Anharmonic Low-Frequency Vibrations},
author = {Brandon Neff and Matthias Heyden},
journal= {arXiv preprint arXiv:2601.02699},
year = {2026}
}
备注
16 pages, 9 figures