基于残基对的蛋白质二级结构预测
生物物理
2007-05-23 v3 q-bio
摘要
用于预测蛋白质二级结构的GOR程序被扩展以包含三重相关性。一个残基对处于特定构象状态的评分系统是从条件权重矩阵推导出来的，该矩阵描述了在残基对处于固定状态的条件下，侧翼窗口每个位置上氨基酸的频率。建立了一个使用该评分系统预测蛋白质二级结构的程序。在使用从PDB_SELECT创建的学习集训练模型后，该程序用两个测试集进行了测试。作为一种使用单序列预测二级结构的方法，该方法达到了接近70%的高准确率。
引用
@article{arxiv.physics/0212065,
title = {Prediction of protein secondary structure based on residue pairs},
author = {Xin Liu and Li-mei Zhang and Wei-Mou Zheng},
journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0212065},
year = {2007}
}
备注
13 pages, 2 figures