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使用深度学习在多地点、多国重症监护队列中预测脓毒症

机器学习 2021-07-13 v1

摘要

尽管有数十年的临床研究,脓毒症仍是一场具有高死亡率和发病率的全球公共卫生危机。目前,当检测到脓毒症并鉴定出潜在病原体时,器官损伤可能已进展至不可逆阶段。因此,有效的脓毒症管理具有高度的时间敏感性。通过系统分析重症监护病房(ICU)中大量临床数据的趋势,脓毒症的早期预测可促成更早的病原体鉴定、耐药检测以及有效的抗生素与支持性治疗,从而成为挽救生命的措施。在此,我们开发并验证了一个用于 ICU 脓毒症预测的机器学习(ML)系统。我们的分析代表了迄今为止使用 ML 进行脓毒症预测的最大多国、多中心 ICU 研究。我们的数据集包含 156,309156,309 例 unique ICU 入院记录,其代表来自三个国家的五个大型 ICU 数据库的精炼与协调子集。使用国际共识定义 Sepsis-3,我们推导出每小时分辨率的脓毒症标签标注,共计 26,73426,734 例(17.1%17.1\%)脓毒症住院。我们将我们的方法(一种深度自注意力模型)与若干临床基线以及 ML 基线进行比较,并在数据库内部与跨数据库进行了广泛的内部与外部验证。平均而言,我们的模型能够以 AUROC 0.847±0.0500.847 \pm 0.050(内部样本外验证)和 0.761±0.0520.761 \pm 0.052(外部验证)预测脓毒症。对于 17%17\% 的协调患病率,在 80%80\% 召回率下,我们的模型以 39%39\% 的精度提前 3.7 小时检测出脓毒症患者。

关键词

引用

@article{arxiv.2107.05230,
  title  = {Predicting sepsis in multi-site, multi-national intensive care cohorts using deep learning},
  author = {Michael Moor and Nicolas Bennet and Drago Plecko and Max Horn and Bastian Rieck and Nicolai Meinshausen and Peter Bühlmann and Karsten Borgwardt},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2107.05230},
  year   = {2021}
}