通过文本增强的药物-基因网络传播交互以预测药物反应
社会与信息网络
2019-06-20 v1
摘要
近年来，个性化药物反应受到公众关注。如何结合基因检测结果与药物敏感性记录被视为实际实施中的关键。研究文献是训练机器进行预测、推断、推理等任务的良好来源。在本项目中，我们结合从生物学研究文献中挖掘的模式与分类数据，构建了一个药物-基因交互网络。随后，我们利用基因与药物敏感性的细胞系实验记录来估计网络中的边嵌入。我们的模型基于基因记录提供药物反应的可解释白盒预测，在二分类药物敏感性预测任务中达到了94.74%的准确率。
引用
@article{arxiv.1906.08089,
title = {Predicting Drug Responses by Propagating Interactions through Text-Enhanced Drug-Gene Networks},
author = {Shiyin Wang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1906.08089},
year = {2019}
}