PolyHoop：支持拓扑转变的软物质颗粒与组织动力学模拟
软凝聚态物质
2024-02-22 v1 生物物理
计算物理
摘要
我们提出 PolyHoop，一个轻量独立的 C++ 机械模型实现，用于模拟二维软物质颗粒与细胞组织的动力学。仅需少量几何与物理参数，PolyHoop 便能模拟广泛的颗粒软物质系统：从生物细胞与组织到囊泡、气泡、泡沫、乳液及其他非晶材料。软颗粒或细胞由连续重塑、非凸、高分辨率多边形表示，可经历生长、分裂、融合、聚集与分离。借助 PolyHoop，由一百万个高空间分辨率细胞组成的组织或泡沫可在常规笔记本电脑上模拟。
引用
@article{arxiv.2307.15006,
title = {PolyHoop: Soft particle and tissue dynamics with topological transitions},
author = {Roman Vetter and Steve V. M. Runser and Dagmar Iber},
journal= {arXiv preprint arXiv:2307.15006},
year = {2024}
}
备注
14 pages, 4 figures, 3 tables