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以生理学为导向的深度学习:面向下一代药代动力学模型的多尺度框架

机器学习 2026-02-24 v1 人工智能 定量方法

摘要

基于生理学的药代动力学(Physiologically Based Pharmacokinetic, PBPK)模型是模型驱动药物开发(MIDD)的基石,提供了预测药物吸收、分布、代谢和排泄(ADME)的机械化框架。尽管具有实用性,但由于大规模模拟的高计算成本、难以为复杂生物系统辨识参数以及跨物种外推的不确定性,仍难以普及。本文提出一种统一的科学机器学习(SciML)框架,构建机械化严谨性与数据驱动灵活性之间的桥梁。我们引入三项贡献:(1)基础药代动力学转换器(Foundation PBPK Transformers),将药代动力学预测作为序列建模任务;(2)生理约束扩散模型(Physiologically Constrained Diffusion Models, PCDM),一种生成方法通过物理信息损失合成生物学合规的虚拟患者群体;(3)神经尺度关系(Neural Allometry),一种混合架构将图神经网络(GNN)与神经常微分方程(Neural ODEs)结合,以学习连续跨物种比例定律。合成数据上的实验表明,在约束下该框架将生理违规率从2.00%降至0.50%,同时为更快的仿真提供了路径。

关键词

引用

@article{arxiv.2602.18472,
  title  = {Physiologically Informed Deep Learning: A Multi-Scale Framework for Next-Generation PBPK Modeling},
  author = {Shunqi Liu and Han Qiu and Tong Wang},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2602.18472},
  year   = {2026}
}